La Section 31 accomplit des missions discrètes ou secrètes pour Starfleet. L'équipe de la Section 31 doit rencontrer l'impératrice destituée Philippa Georgiou. Celle-ci ne contrôle plus son tueur Godsend, qui est d'une énorme puissance.

En Alaska, des disparitions mystérieuses ont lieu depuis les années 60. Au cours de séances d'hypnose d'Abigail, une psychothérapeute, certains patients deviennent fous, allant même parfois jusqu'à se suicider.