Les deux frères de Rukia ont utilisé leur pouvoir pour supprimer Rukia de la mémoire collective. Plus personne ne se rappelle de Rukia, excepté Ichigo, qui a une connexion spéciale avec elle, car il a reçu une partie de ses pouvoirs.

Un artefact, le «Sceau du Roi», est dérobé pendant un transfert. Toshiro, chargé de la sécurité de l'artefact, est blessé par les voleurs et porté disparu. Le Seireitei le soupçonne alors d'avoir trahi et ordonne qu'il soit capturé.

Ichigo et Rukia travaillent pour la Soul Society: ils font le tri entre les bonnes âmes et les mauvaises, les Hollows, éliminées grâce à leurs pouvoirs spéciaux. Un jour, une faille apparaît, menaçant de détruire leur monde et le monde réel.