Flint, inventeur génial mais loufoque, s'aperçoit que sa machine à transformer l'eau en nourriture n'est pas détruite comme il le croyait. Celle-ci fabrique désormais des croisements entre aliments et animaux, comme les hippopatates.

Cette fois-ci Boog découvre l'univers du cirque. Lâché par ses potes qui ont des obligations familiales, Boog part seul à l'aventure et tombe dans un cirque.