Yasumoto, après avoir fini ses études de médecin à Nagasaki, revient dans sa ville natale - Tokyo - où il espère faire une brillante carrière. Mais il est déçu par sa première affectation, dans un quartier pauvre, auprès du Dr Barberousse.

Neufs samouraï combattent un système de corruption dont leur maître, le chambellan Mutsuta est la victime. Ils tombent dans un piège, mais gagnent l'aide de Sanjuro, un samouraï hirsute et débraillé, pourtant grand et rusé combattant.