Un couple reçoit une mystérieuse boîte d'un inconnu. Si ils appuient sur le bouton rouge de la boîte deux choses vont se produire: ils recevront un versement d'un million de dollars et une personne qu'ils ne connaissent pas mourra.
La troisième guerre mondiale a débuté. Des bombes atomiques ont explosé. Pour son indépendance énergétique, les USA construisent un générateur quantique. Mais ce générateur met la réalité même en péril. Est-ce la fin du monde ?
Donnie Darko est un adolescent bizarre: il a pour ami Frank, un personnage qu'il est le seul à pouvoir voir et entendre. Frank est une sorte de lapin géant au visage terrifiant. Il en parle à une psychologue.