En 2025, Tokyo a pour nom Zebra City. Zebraman a perdu ses super-pouvoirs et il est amnésique. Le maire a instauré le Zebra Time: cinq minutes par jour, la police est autorisée à tirer à vue sur tous les délinquants.

Un homme commet un crime passionnel: il tue sa femme adultère, puis se rend à la police. Après 8 années de prison, il est libéré et ouvre un salon de coiffure, menant un existence taciturne. Il sauve Keiko, une jeune femme, du suicide.