Anna, une jeune orpheline, est séduite par un coureur de jupon sans scrupule, puis abandonnée. Elle se retrouve seule et enceinte. L'enfant meurt peu après la naissance. Anna est rejetée par son entourage et tente de se reconstruire.
Le film dénonce l'intolérance en faisant des allers-retours entre quatre époques différentes : pendant la répression des grèves, le massacre de la Saint-Barthélemy, la Passion du Christ et Babylone.
La guerre de Sécession endeuille deux familles américaines, l'une étant favorable à la cause nordiste, l'autre à la cause sudiste. Après la guerre, Lincoln est assassiné, et le Ku Klux Klan naît en réaction contre les noirs.
